RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 PRKCGP05129 697 aa20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 USP17L7P0C7H9 530 aa20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 MLNP12872 115 aa20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 CRADDP78560 199 aa20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 CNGA3Q16281 694 aa20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 FAM171BQ6P995 826 aa20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 CCDC185Q8N715 623 aa20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 E9PBE3 544 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 KLHL41O60662 606 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 CPA3P15088 417 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 TYK2P29597 1187 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 MATKP42679 507 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 PPM1JQ5JR12 505 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 FAM131BQ86XD5 332 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 URGCPQ8TCY9 931 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 COG4Q9H9E3 785 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 ZNF487B1APH4 448 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 HHLA1C9JL84 531 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 F5H423 210 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 ZBTB14O43829 449 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 TMCC1O94876 653 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 PGAM1P18669 254 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 SH2D4BQ5SQS7 431 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 EPGNQ6UW88 154 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 ADAM32Q8TC27 787 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 LRGUKQ96M69 825 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 SERPINI1Q99574 410 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 CDH19Q9H159 772 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 PSAT1Q9Y617 370 aa20.49■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 HSPA4LO95757 839 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 FYNP06241 537 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 SCNN1AP37088 669 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 NR2C2P49116 596 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 SULT1E1P49888 294 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 CCDC153Q494R4 210 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 PKMYT1Q99640 499 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 STK39Q9UEW8 545 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 RAB26Q9ULW5 256 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 CCDC160A6NGH7 325 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 DNAJA2O60884 412 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 PBX3P40426 434 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 USP4Q13107 963 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 B3GALT6Q96L58 329 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 LZTS1Q9Y250 596 aa20.48■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 VILLO15195 856 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 MGAT1P26572 445 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 ABI1Q8IZP0 508 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 CATSPER1Q8NEC5 780 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 HIPK3Q9H422 1215 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 PLK2Q9NYY3 685 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 DSEQ9UL01 958 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 SCN5AQ14524 2016 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 PITPNM1O00562 1244 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 TFAP2AP05549 437 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 NUDT2P50583 147 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 NME3Q13232 169 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 SLC25A52Q3SY17 297 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 C16orf89Q6UX73 402 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 UBAP1Q9NZ09 502 aa20.47■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 TSC2P49815 1807 aa20.46■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 M0QYT0 321 aa20.46■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 CRTAMO95727 393 aa20.46■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 CYP2C18P33260 490 aa20.46■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 DAOAP59103 153 aa20.46■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
VGF-201ENST00000249330 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms