RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 EPAS1Q99814 870 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 TEX264Q9Y6I9 313 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 E9PAM4 449 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 H3BRJ5 948 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ZWINTO95229 277 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 AMPD1P23109 780 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 RBL1P28749 1068 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 TPI1P60174 286 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 MTA1Q13330 715 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 PDK4Q16654 411 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 RFX8Q6ZV50 586 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 HTR3DQ70Z44 454 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 RIN3Q8TB24 985 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 KRT4P19013 534 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 TACR2P21452 398 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 SLC6A4P31645 630 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 MTHFRP42898 656 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ARTNQ5T4W7 220 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 CGB2Q6NT52 195 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 Q6ZNB5 142 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 CHSY1Q86X52 802 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 KLC2Q9H0B6 622 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 POMKQ9H5K3 350 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 CD207Q9UJ71 328 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 EPHB2P29323 1055 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 HCAR3P49019 387 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 MTM1Q13496 603 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ADGRF1Q5T601 910 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 MANEALQ5VSG8 457 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 HHATQ5VTY9 493 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 FBXL22Q6P050 247 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 MZB1Q8WU39 189 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 KLC4Q9NSK0 619 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 GDE1Q9NZC3 331 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 MAGEA6P43360 314 aa20.33■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 DPYSQ14117 519 aa20.33■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 RNF43Q68DV7 783 aa20.33■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ASB16Q96NS5 453 aa20.33■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 MYADMQ96S97 322 aa20.33■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 CDH7Q9ULB5 785 aa20.33■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 NEU3Q9UQ49 428 aa20.33■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 UBOX5O94941 541 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 LATS1O95835 1130 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ERCC2P18074 760 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 KCNA5P22460 613 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 WEE1P30291 646 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 VIPR2P41587 438 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 NR2C2P49116 596 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SLC1A5Q15758 541 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ZNF77Q15935 545 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 LGI2Q8N0V4 545 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 LRRC8CQ8TDW0 803 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SMARCD2Q92925 531 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 IGSF8Q969P0 613 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 MPP6Q9NZW5 540 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 E2F8A0AVK6 867 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms