RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628795.2

GREB1-210, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene GREB1, Length 438 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-210ENST00000628795 ROR1Q01973 937 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 GAD2Q05329 585 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 RAD51Q06609 339 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 VAC14Q08AM6 782 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 ZNF543Q08ER8 600 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 NIPAL4Q0D2K0 466 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 BFSP2Q13515 415 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 PEX6Q13608 980 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 PCLAFQ15004 111 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CDK10Q15131 360 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 NPTX1Q15818 432 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 ATP6AP1Q15904 470 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 HADHQ16836 314 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 PGS1Q32NB8 556 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CDONQ4KMG0 1287 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 MTX3Q5HYI7 312 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 TJAP1Q5JTD0 557 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CEP78Q5JTW2 689 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 ZNF484Q5JVG2 852 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 SEL1L3Q68CR1 1132 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CTRB2Q6GPI1 263 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 ZNF544Q6NX49 715 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 PRMT9Q6P2P2 845 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 SYCE2Q6PIF2 218 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CRTC3Q6UUV7 619 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 USP51Q70EK9 711 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 FKBP9P1Q75LS8 142 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 PRSS48Q7RTY5 328 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 C14orf80Q86SX3 495 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 SLC22A16Q86VW1 577 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 HORMAD1Q86X24 394 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 C10orf107Q8IVU9 208 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 DNAJC10Q8IXB1 793 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CPNE9Q8IYJ1 553 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CLYBLQ8N0X4 340 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 ABRAQ8N0Z2 381 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 MFSD4AQ8N468 514 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 RDH13Q8NBN7 331 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 FBXL13Q8NEE6 735 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 OR2T34Q8NGX1 318 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 OR2T3Q8NH03 318 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 ACTL9Q8TC94 416 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 GIMAP1Q8WWP7 306 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CPA5Q8WXQ8 436 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 LPGAT1Q92604 370 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CDKL2Q92772 493 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 SEMA4DQ92854 862 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 TP53INP1Q96A56 240 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 SLCO4A1Q96BD0 722 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 SDCCAG3Q96C92 435 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 FAF2Q96CS3 445 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 PGBD4Q96DM1 585 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 SLC45A3Q96JT2 553 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 SPATA17Q96L03 361 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CEP295NLQ96MC4 621 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 FBXL18Q96ME1 805 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 VPS35Q96QK1 796 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CPXM1Q96SM3 734 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 MMP19Q99542 508 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CIB1Q99828 191 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 HSD17B14Q9BPX1 270 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 MUC13Q9H3R2 512 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 JMJD4Q9H9V9 463 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 FANCEQ9HB96 536 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 POPDC2Q9HBU9 364 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 PCDH12Q9NPG4 1184 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 NECTIN3Q9NQS3 549 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.632e-7■■■■□ 22.3
GREB1-210ENST00000628795 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 SYBUQ9NX95 663 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 SNTG2Q9NY99 539 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 ADA2Q9NZK5 511 aa4.85□□□□□ -1.63
GREB1-210ENST00000628795 HSPBP1Q9NZL4 362 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms