RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 DAOAP59103 153 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MPP7Q5T2T1 576 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 NADSYN1Q6IA69 706 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC17Q96AE7 1141 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A18Q96N87 628 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC4Q9HBW1 653 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PPC4 97 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM191CA6NGB0 347 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 DYNC1I1O14576 645 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 VILLO15195 856 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 PAFAH1B1P43034 410 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN6P56747 220 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 USP30Q70CQ3 517 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM110Q86TL2 294 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF139Q8WU17 664 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35F5Q8WV83 523 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCC13Q9NSE7 274 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC66A2RUB6 948 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 M0QYV0 167 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 CBX4O00257 560 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 WNT9AO14904 365 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 TBL1XO60907 577 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SRGAP2O75044 1071 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PROSCO94903 275 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 CTNNA2P26232 953 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC8A3P57103 927 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 RACK1P63244 317 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PDCLQ13371 301 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPN20Q4JDL3 420 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 GATAD2AQ86YP4 633 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 FNIP1Q8TF40 1166 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 COG1Q8WTW3 980 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA1Q92805 767 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 CARD9Q9H257 536 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 CNGB3Q9NQW8 809 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SUN2Q9UH99 717 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 CYTH4Q9UIA0 394 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SIN3BO75182 1162 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 MESDQ14696 234 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 RASGEF1CQ8N431 466 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 HSFY1Q96LI6 401 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 FTSJ1Q9UET6 329 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ANAPC7Q9UJX3 599 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP46Q8IYW2 2715 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PR77 199 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 E9PAM4 449 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 COMTP21964 271 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SCNN1AP37088 669 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC157Q569K6 752 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 C9orf64Q5T6V5 341 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PMF1Q6P1K2 205 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 NCEH1Q6PIU2 408 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 TMPRSS12Q86WS5 348 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 FIBINQ8TAL6 211 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SAP25Q8TEE9 199 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC4CQ8WTT0 213 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 UBXN4Q92575 508 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 CPXM1Q96SM3 734 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXL12Q9NXK8 326 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 MGAQ8IWI9 3026 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PLK4O00444 970 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ACSL4O60488 711 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 CSKP41240 450 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ACADSBP45954 432 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PEX5P50542 639 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 FSCBQ5H9T9 825 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 XYLT1Q86Y38 959 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 NIPA2Q8N8Q9 360 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 NEUROG2Q9H2A3 272 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SCML1Q9UN30 329 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
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