RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM69Q86WT6 500 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 PNPLA1Q8N8W4 532 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 NTAN1Q96AB6 310 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ARRDC3Q96B67 414 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC114Q96M63 670 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 CDC6Q99741 560 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 TNKS2Q9H2K2 1166 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM248Q9NWD8 314 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 MYO6Q9UM54 1294 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 DOCK4Q8N1I0 1966 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 LRIG2O94898 1065 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC172P0C7W6 258 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 NUDT1P36639 197 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ACVRL1P37023 503 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 MAPKAPK2P49137 400 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 CCT8P50990 548 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ARSIQ5FYB1 569 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 CEP44Q9C0F1 390 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 FRYQ5TBA9 3013 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 USP24Q9UPU5 2620 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 TLR4O00206 839 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 PRNPP04156 253 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 SCAPQ12770 1279 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 SHBQ15464 509 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 MFSD2AQ8NA29 543 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 PREBQ9HCU5 417 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 TOR4AQ9NXH8 423 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 IL36AQ9UHA7 158 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 DNAI1Q9UI46 699 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 DMTF1Q9Y222 760 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ACTL7AQ9Y615 435 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 WASF2Q9Y6W5 498 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 PLXNA2O75051 1894 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 DKK1O94907 266 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 GRK6P43250 576 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 NXPH1P58417 271 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 IL9RQ01113 521 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 NEK5Q6P3R8 708 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 HDAC8Q9BY41 377 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 MAGEH1Q9H213 219 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 CCP110O43303 1012 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 TNFAIP3P21580 790 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 L1CAMP32004 1257 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ETFBP38117 255 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF165P49910 485 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC15Q0P6D6 951 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC45A4Q5BKX6 768 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 CARD16Q5EG05 197 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 PLPP6Q8IY26 295 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 PYROXD2Q8N2H3 581 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 MCEEQ96PE7 176 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 GDF3Q9NR23 364 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 LEFTY1O75610 366 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 IQCB1Q15051 598 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 IQCHQ86VS3 1027 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 SAP25Q8TEE9 199 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 HEPHQ9BQS7 1158 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 CNPY3Q9BT09 278 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 DYRK4Q9NR20 520 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 FZD10Q9ULW2 581 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM131Q92545 1883 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP1CC-211ENST00000620030 A0A1B0GTH6 734 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP1CC-211ENST00000620030 A0A1W2PQC6 194 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP1CC-211ENST00000620030 LRRC53A6NM62 1247 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP1CC-211ENST00000620030 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP1CC-211ENST00000620030 TNFSF14O43557 240 aa24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms