RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 ATP6V1B1P15313 513 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC38Q5VT99 294 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF621Q6ZSS3 439 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 GPR20Q99678 358 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.43■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 CPA6Q8N4T0 437 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 SEPHS2Q99611 448 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 SNX6Q9UNH7 406 aa20.43■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 KCNA10Q16322 511 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 CASP12Q6UXS9 341 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 ALG9Q9H6U8 611 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 KLQ9UEF7 1012 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 GPR158Q5T848 1215 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 MON1AQ86VX9 555 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.868e-6■■■□□ 17.7
CTDP1-208ENST00000613122 FGD3Q5JSP0 725 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 COMMD2Q86X83 199 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.42■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.42■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.42■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 A0A0B4J269 797 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 CES1P23141 567 aa20.42■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 DUX4L2P0CJ85 424 aa20.42■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 DUX4L4P0CJ87 422 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 DUX4L5P0CJ88 424 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 DUX4L6P0CJ89 424 aa20.42■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 DUX4Q9UBX2 424 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.42■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 URADA6NGE7 173 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 EPN2O95208 641 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 APODP05090 189 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 FASP25445 335 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 PRKCIP41743 596 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 PFKFB4Q16877 469 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 EID3Q8N140 333 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 COL26A1Q96A83 441 aa20.41■□□□□ 0.86
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