RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC185Q8N715 623 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 MDM1Q8TC05 714 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 RAPGEF5Q92565 580 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 SYT11Q9BT88 431 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 ACTL7AQ9Y615 435 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP295Q9C0D2 2601 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM72CH0Y354 149 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV3-25P01717 112 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FTLP02792 175 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 TDGF1P13385 188 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 NOS2P35228 1153 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 PLTPP55058 493 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 LMAN2Q12907 356 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 AUHQ13825 339 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 SPRED3Q2MJR0 410 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FUT11Q495W5 492 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM72AQ5TYM5 149 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM72DQ6L9T8 149 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 C6orf89Q6UWU4 347 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP68Q76N32 757 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM72BQ86X60 149 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 CPNE8Q86YQ8 564 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 UNC45BQ8IWX7 931 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 SCML4Q8N228 414 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 CABS1Q96KC9 395 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 NPY6RQ99463 290 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB17Q9H0T7 212 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 CARD9Q9H257 536 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 CHD8Q9HCK8 2581 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 TIMM44O43615 452 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 LSM8O95777 96 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 SHBGP04278 402 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 BCKDHBP21953 392 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 PRKCHP24723 683 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 MPPE1Q53F39 396 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC121Q6ZUS5 278 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 MON1BQ7L1V2 547 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA2013Q8IYS2 634 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 ELOVL2Q9NXB9 296 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 PCSK1NQ9UHG2 260 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 BLOC1S6Q9UL45 172 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX24Q9Y343 169 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FREM2Q5SZK8 3169 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 TPRP12270 2363 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 SMIM23A6NLE4 172 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 AXIN1O15169 862 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 EPHX1P07099 455 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 GABRB2P47870 512 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 MARCKSL1P49006 195 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 GSCP56915 257 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF234Q14588 700 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC24Q6P3W2 148 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 DCUN1D2Q6PH85 259 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 KBTBD6Q86V97 674 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF276Q8N554 614 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM172AQ8WUF8 416 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 BTN2A3PQ96KV6 586 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 ERP44Q9BS26 406 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 ZSCAN32Q9NX65 697 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 MARK1Q9P0L2 795 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 GGA2Q9UJY4 613 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 MMP17Q9ULZ9 603 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FRYQ5TBA9 3013 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PQF6 199 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 F5H5T6 163 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 TCF4P15884 667 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 SDC4P31431 198 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 DUPD1Q68J44 220 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 LINGO4Q6UY18 593 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 SYT13Q7L8C5 426 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 ADIPOR2Q86V24 386 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 JAMLQ86YT9 394 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEFF1Q8IYR6 380 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 MCOLN2Q8IZK6 566 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXO25Q8TCJ0 367 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 KRT35Q92764 455 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 NDFIP2Q9NV92 336 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP12.81□□□□□ -0.367e-6■□□□□ 9.5
RABGEF1-209ENST00000607882 STON1Q9Y6Q2 735 aa12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms