RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	KNTC1	P50748	2209 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	OR1E1	P30953	314 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	SCNN1A	P37088	669 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	BPIFB4	P59827	614 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF284	Q2VY69	593 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	SPON2	Q9BUD6	331 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	RRN3	Q9NYV6	651 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	GGT7	Q9UJ14	662 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	TRIM38	O00635	465 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	ALOX15B	O15296	676 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	RAD51B	O15315	384 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC7A4	O43246	635 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	LEFTY1	O75610	366 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	OXCT1	P55809	520 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	OR13H1	Q8NG92	308 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	TSC1	Q92574	1164 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	FANCL	Q9NW38	375 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	ITM2B	Q9Y287	266 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	LRP4	O75096	1905 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	SPINT1	O43278	529 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	THEGL	P0DJG4	465 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	GIMD1	P0DJR0	217 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	SOX5	P35711	763 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	ABL2	P42684	1182 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	HDAC4	P56524	1084 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	KRT83	P78385	493 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	CDR2	Q01850	454 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	GNA12	Q03113	381 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	NLRP14	Q86W24	1093 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC25A45	Q8N413	288 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	C1orf74	Q96LT6	269 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	KLC2	Q9H0B6	622 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	IL36A	Q9UHA7	158 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	DACH1	Q9UI36	760 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	DNAI1	Q9UI46	699 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		15.15	■□□□□ 0.02
FCHO1-231	ENST00000600201	ILVBL	A1L0T0	632 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	RFPL3	O75679	317 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	F9	P00740	461 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	MMP8	P22894	467 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	RXRG	P48443	463 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	DNA2	P51530	1060 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	SNX16	P57768	344 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	SYCP1	Q15431	976 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	HES3	Q5TGS1	186 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	LRRC31	Q6UY01	552 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	HORMAD1	Q86X24	394 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	HAPLN3	Q96S86	360 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	PREB	Q9HCU5	417 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		15.14	■□□□□ 0.01
FCHO1-231	ENST00000600201	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		15.14	■□□□□ 0.01

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