RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 NFATC1O95644 943 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 AP2A1O95782 977 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ADH1CP00326 375 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TYRP14679 529 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF235Q14590 738 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 PDGFRLQ15198 375 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CBX4O00257 560 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 SUN1O94901 812 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 LAMP2P13473 410 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 LMAN2Q12907 356 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 DMC1Q14565 340 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD11Q693B1 232 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 MFSD6LQ8IWD5 586 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP2A3Q93084 1043 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 MYADMQ96S97 322 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC40Q9H9A6 602 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 AP3B1O00203 1094 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMPSTE24O75844 475 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 GEMP55040 296 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 GAD2Q05329 585 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 FCHO2Q0JRZ9 810 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 DHCR24Q15392 516 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHG6Q3KR16 790 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ALG1LQ6GMV1 187 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 RETSATQ6NUM9 610 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ELSPBP1Q96BH3 223 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 LMLNQ96KR4 655 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINB12Q96P63 405 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 PSKH2Q96QS6 385 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 NT5MQ9NPB1 228 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS45Q9NRW7 570 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 CD207Q9UJ71 328 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA8MH3BSY2 632 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 CES1P23141 567 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ARF5P84085 180 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC20A2Q08357 652 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00523Q86TU6 105 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC39Q96DD0 335 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC25Q96NG3 672 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 GORASP1Q9BQQ3 440 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ACBD3Q9H3P7 528 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 POMKQ9H5K3 350 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ALOX15BO15296 676 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP17A1P05093 508 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 MPP3Q13368 585 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC14A2Q15849 920 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP58Q5T655 872 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 TANGO2Q6ICL3 276 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR153Q6NV75 609 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SUSD6Q92537 303 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM83CQ9BQN1 747 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS51Q9UID3 782 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC4EQ9ULY5 219 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 TTLL3Q9Y4R7 772 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ADH5P11766 374 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD17B3P37058 310 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEA3P43357 314 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEA4P43358 317 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM182AQ5T1J6 154 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ALS2CLQ60I27 953 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC8BQ6P9F7 803 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 MTSS1LQ765P7 747 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 OTOP3Q7RTS5 596 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP31.54■■■□□ 2.64
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CAPNS1-206ENST00000588815 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SAYSD1Q9NPB0 183 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO10Q9UK96 956 aa31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 GLDCP23378 1020 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-FP30511 346 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SULT2A1Q06520 285 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 VITQ6UXI7 678 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 MICALL1Q8N3F8 863 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 PWWP2AQ96N64 755 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCB8Q9NUT2 735 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 REV3LO60673 3130 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ECI2O75521 394 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 CD70P32970 193 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 FNBP1LQ5T0N5 605 aa31.52■■■□□ 2.64
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