RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SDR42E2A6NKP2 422 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ETV4P43268 484 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 CXCR3P49682 368 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS36Q5K4E3 855 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 FYB2Q5VWT5 728 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 SYPL2Q5VXT5 272 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 PYROXD2Q8N2H3 581 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 P2RY11Q96G91 374 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCF3Q9NUQ8 709 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 PROB1E7EW31 1015 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 AVILO75366 819 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 TGDSO95455 350 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINB6P35237 376 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 SPRED3Q2MJR0 410 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 STXBP5Q5T5C0 1151 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF276Q8N554 614 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ING5Q8WYH8 240 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 PKMYT1Q99640 499 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D17Q9HA65 648 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 PLAC1Q9HBJ0 212 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGEF3Q9NR81 526 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 GDE1Q9NZC3 331 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 TRHDEQ9UKU6 1024 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 USP34Q70CQ2 3546 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 YJEFN3A6XGL0 299 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 E7ENQ6 273 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 AP3B1O00203 1094 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF103O00237 685 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 VNN2O95498 520 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 SETDB1Q15047 1291 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 FAXCQ5TGI0 409 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 BHLHA9Q7RTU4 235 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 PPM1NQ8N819 430 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 ACMSDQ8TDX5 336 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 EPAS1Q99814 870 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 GRID1Q9ULK0 1009 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 UBOX5O94941 541 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC63Q8NA47 563 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 DTWD2Q8NBA8 298 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 CDKL2Q92772 493 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 MYLPFQ96A32 169 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 OSBPL2Q9H1P3 480 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 CEBPBP17676 345 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 PGAM1P18669 254 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 NBL1P41271 181 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 CCR2P41597 374 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 STARD6P59095 220 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 TPI1P60174 286 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 WASHC5Q12768 1159 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 NME3Q13232 169 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 HDAC11Q96DB2 347 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 TCEAL4Q96EI5 215 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 KXD1Q9BQD3 176 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 CORO1BQ9BR76 489 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM49D1C9J1S8 452 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 COPEO14579 308 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 NCAM1P13591 858 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 ERCC2P18074 760 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 ADRA1DP25100 572 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 CTAGE3PQ8IX95 158 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 SERAC1Q96JX3 654 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 LGMNQ99538 433 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 MANSC1Q9H8J5 431 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 KLC4Q9NSK0 619 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 TXLNGQ9NUQ3 528 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 STK25O00506 426 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMD3O43242 534 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 ECI2O75521 394 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP3K6O95382 1288 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNB1P14635 433 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 CPB1P15086 417 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 COG7P83436 770 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK18Q07002 472 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 AP1B1Q10567 949 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR17Q13304 367 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 BRMS1LQ5PSV4 323 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXW10Q5XX13 1052 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGEC3Q8TD91 643 aa25.91■■□□□ 1.74
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