RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586065.1

PTPRS-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRS, Length 388 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-203ENST00000586065 HOXA6P31267 233 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 DGKEP52429 567 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 NDST2P52849 883 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 SULT2A1Q06520 285 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 SERINC3Q13530 473 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 PDK2Q15119 407 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 TAZQ16635 292 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 KCTD6Q8NC69 237 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 ZNF487B1APH4 448 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 KDELR3O43731 214 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 FTCDO95954 541 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 CTNNA2P26232 953 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 ETFBP38117 255 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 ST8SIA6P61647 398 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 Q6ZVU0 165 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 CACUL1Q86Y37 369 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 HMGB4Q8WW32 186 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 ALG3Q92685 438 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 PTPRN2Q92932 1015 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 VOPP1Q96AW1 172 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 MRGPRX1Q96LB2 322 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 EBF1Q9UH73 591 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-203ENST00000586065 J3KR12 359 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 GIPC1O14908 333 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 MAP3K6O95382 1288 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 ZNF806P0C7X5 589 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 C7P10643 843 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 CDKN2BP42772 138 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 PEX5P50542 639 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 GBE1Q04446 702 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 ADCY2Q08462 1091 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 DLG2Q15700 870 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 SDE2Q6IQ49 451 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 VSIG1Q86XK7 387 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 PLD5Q8N7P1 536 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 RNF157Q96PX1 679 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 RNF103O00237 685 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 DFFAO00273 331 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 KRT86O43790 486 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 NRDCO43847 1150 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 PRAMEF11O60813 436 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 PEX11BO96011 259 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 METAP1P53582 386 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 FOXC1Q12948 553 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 STARD3Q14849 445 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 E2F5Q15329 346 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRS-203ENST00000586065 RETSATQ6NUM9 610 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms