RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 PSTPIP1O43586 416 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ATP9AO75110 1047 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CCNE2O96020 404 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 AGTP01019 485 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 LMNAP02545 664 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CALB1P05937 261 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 KRT5P13647 590 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 DESP17661 470 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ADSSP30520 456 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ADRA1BP35368 520 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ARL2P36404 184 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 DNA2P51530 1060 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 IL2P60568 153 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CDC42EP1Q00587 391 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 CCNG2Q16589 344 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ZACNQ401N2 412 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 MCOLN2Q8IZK6 566 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 GPC2Q8N158 579 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 REPS2Q8NFH8 660 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SEPT1Q8WYJ6 367 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CD101Q93033 1021 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF653Q96CK0 615 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 NUP85Q9BW27 656 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 HACL1Q9UJ83 578 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CLDN3O15551 220 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 PROSCO94903 275 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TJP3O95049 919 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 STBD1O95210 358 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 KRT14P02533 472 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 CHRNB2P17787 502 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PROZP22891 400 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 MGAT1P26572 445 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 HMGCS2P54868 508 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PLTPP55058 493 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 FMO1Q01740 532 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PRKCEQ02156 737 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TNFAIP2Q03169 654 aa4.74□□□□□ -1.65
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