RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	OAZ2	O95190	189 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	IFNA2	P01563	188 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	PRPH2	P23942	346 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	GRK6	P43250	576 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	POLD2	P49005	469 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	RCAN1	P53805	252 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	AP2B1	P63010	937 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	RHAG	Q02094	409 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	FOXO1	Q12778	655 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	MAGEH1	Q9H213	219 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	PPCS	Q9HAB8	311 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	DACT1	Q9NYF0	836 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	LRFN1	Q9P244	771 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	PKP3	Q9Y446	797 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		3.76	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	TOMM70	O94826	608 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ALPL	P05186	524 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	CIITA	P33076	1130 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	HAL	P42357	657 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	PKP1	Q13835	747 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	MYCT1	Q8N699	235 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	CCT6B	Q92526	530 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	NLRP4	Q96MN2	994 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	NRAP	Q86VF7	1730 aa		3.75	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	DPPA5	A6NC42	116 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	GRM8	O00222	908 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	MDM4	O15151	490 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	PIP5K1C	O60331	668 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	NFATC1	O95644	943 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	THBS3	P49746	956 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	HTR6	P50406	440 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	POLE2	P56282	527 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	P2RX3	P56373	397 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	PTGR1	Q14914	329 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	MTFR2	Q6P444	385 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	KDM1B	Q8NB78	822 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	SPATA5	Q8NB90	893 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ASB5	Q8WWX0	329 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ABHD8	Q96I13	439 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084		Q9N2J8	555 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	FZD3	Q9NPG1	666 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		3.74	□□□□□ -1.81
COX11-208	ENST00000576084	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81

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