RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 RWDD2AQ9UIY3 292 aa15.88■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 PIAS2O75928 621 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 C1QL1O75973 258 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 GIMD1P0DJR0 217 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 AKT2P31751 481 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 DEUP1Q05D60 604 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 CAMK4Q16566 473 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 ERICH1Q86X53 443 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 DCAF4L2Q8NA75 395 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 TMIEQ8NEW7 156 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 BAP1Q92560 729 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 SPON2Q9BUD6 331 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 KLHL11Q9NVR0 708 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 IL36AQ9UHA7 158 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 ACTL7AQ9Y615 435 aa15.87■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 LEFTY1O75610 366 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 NEBLO76041 1014 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 PRNPP04156 253 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 FLT3P36888 993 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 MTA1Q13330 715 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 HS1BP3Q53T59 392 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 BRMS1LQ5PSV4 323 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 TAF3Q5VWG9 929 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 TRNP1Q6NT89 227 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 SLC39A7Q92504 469 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 FGF11Q92914 225 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 PDCL3Q9H2J4 239 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 WASF2Q9Y6W5 498 aa15.86■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 DRGXA6NNA5 263 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 GOLGA8SH3BPF8 625 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 RAD51BO15315 384 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 SRGAP2O75044 1071 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 MPOP05164 745 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 OR1E1P30953 314 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 ACTN2P35609 894 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 DNA2P51530 1060 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 TLE3Q04726 772 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 FGL2Q14314 439 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 TBC1D25Q3MII6 688 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 ARTNQ5T4W7 220 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 NEK5Q6P3R8 708 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 LRRC31Q6UY01 552 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 Q6ZSR6 202 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 NT5C3BQ969T7 300 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 APOLD1Q96LR9 279 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 RRN3Q9NYV6 651 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 U3KQA8 63 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 CHD5Q8TDI0 1954 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 ATMQ13315 3056 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 KIF26BQ2KJY2 2108 aa15.85■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 TENM4Q6N022 2769 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 POM121BA6NF01 834 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 OPA1O60313 960 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 CKMT1AP12532 417 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 ADRB3P13945 408 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 CLCN6P51797 869 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 NEK3P51956 506 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 SNX16P57768 344 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 CXADRP78310 365 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 E2F1Q01094 437 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 RAB6CQ53S08 254 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 FAM131BQ86XD5 332 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 XYLT1Q86Y38 959 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 SPACA3Q8IXA5 215 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 DRC7Q8IY82 874 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 FAM71AQ8IYT1 594 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 OR6K2Q8NGY2 324 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 LGMNQ99538 433 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 HDAC8Q9BY41 377 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 RAB6CQ9H0N0 254 aa15.84■□□□□ 0.13
NME3-211ENST00000568561 OSBPL2Q9H1P3 480 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms