RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	FAM92A	A1XBS5	289 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	TM9SF1	O15321	606 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	PYGB	P11216	843 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	MYL4	P12829	197 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	PGAM1	P18669	254 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	ADRA1D	P25100	572 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	COG7	P83436	770 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF33A	Q06730	810 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	TEX44	Q53QW1	395 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	HHAT	Q5VTY9	493 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	CASC4	Q6P4E1	433 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	GPR149	Q86SP6	731 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	ITFG1	Q8TB96	612 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	CCT6B	Q92526	530 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	SLC39A13	Q96H72	371 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	APOPT1	Q96IL0	206 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	VAT1	Q99536	393 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	THEG	Q9P2T0	379 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TCF4-231	ENST00000566279	HMX2	A2RU54	273 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	KRT37	O76014	449 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	RHO	P08100	348 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	NFKB1	P19838	968 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	EPHB3	P54753	998 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	SMARCB1	Q12824	385 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	CRYM	Q14894	314 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	AFMID	Q63HM1	303 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	CES5A	Q6NT32	575 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	SPATA21	Q7Z572	469 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	C14orf80	Q86SX3	495 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	TMC8	Q8IU68	726 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	CCNJL	Q8IV13	435 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	PSMG2	Q969U7	264 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	TEKT5	Q96M29	485 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	TSGA13	Q96PP4	275 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	CASS4	Q9NQ75	786 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279		A0A1W2PRU2	124 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	VGLL3	A8MV65	326 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279		E9PAM4	449 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	DFFA	O00273	331 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	USP12	O75317	370 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	JCHAIN	P01591	159 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	ALAD	P13716	330 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	HOXA9	P31269	272 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	CCNF	P41002	786 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	ETV4	P43268	484 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	TUB	P50607	506 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	CYP4F8	P98187	520 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	DNAJC3	Q13217	504 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	BMPR2	Q13873	1038 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF276	Q8N554	614 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	CNTD1	Q8N815	330 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	TTC17	Q96AE7	1141 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	NAT9	Q9BTE0	207 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	LRRC3	Q9BY71	257 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TCF4-231	ENST00000566279	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		10.33	□□□□□ -0.76

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