RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559389.1

SNX1-206, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNX1, Length 753 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-206ENST00000559389 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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SNX1-206ENST00000559389 NR2C2P49116 596 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX1-206ENST00000559389 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SNX1-206ENST00000559389 ACCSLQ4AC99 568 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX1-206ENST00000559389 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX1-206ENST00000559389 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX1-206ENST00000559389 RASSF3Q86WH2 238 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX1-206ENST00000559389 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.08■■□□□ 1.13
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SNX1-206ENST00000559389 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.07■■□□□ 1.12
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SNX1-206ENST00000559389 P3H4Q92791 437 aa22.07■■□□□ 1.12
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SNX1-206ENST00000559389 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.07■■□□□ 1.12
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SNX1-206ENST00000559389 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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SNX1-206ENST00000559389 OR2A12Q8NGT7 310 aa22.06■■□□□ 1.12
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SNX1-206ENST00000559389 DMWDQ09019 674 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.04■■□□□ 1.12
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SNX1-206ENST00000559389 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.04■■□□□ 1.12
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SNX1-206ENST00000559389 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 WDR24Q96S15 920 aa22.04■■□□□ 1.12
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SNX1-206ENST00000559389 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 SEPT3Q9UH03 358 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 EBF1Q9UH73 591 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 MCF2LO15068 1137 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 MATN3O15232 486 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 BNIP3LO60238 219 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 SP9P0CG40 484 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNX1-206ENST00000559389 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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