RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TNNI3P19429 210 aa8.61□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.61□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 APODP05090 189 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 NFKB1P19838 968 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 XIAPP98170 497 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 RFX4Q33E94 735 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 AGKQ53H12 422 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 RNF43Q68DV7 783 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 PNKPQ96T60 521 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 RACGAP1Q9H0H5 632 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.6□□□□□ -1.03
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