RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 ADRA1DP25100 572 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RFX3P48380 749 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ITGA1P56199 1179 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RAB14P61106 215 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 BEX3Q00994 111 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CBWD6Q4V339 395 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 WSCD1Q658N2 575 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SAR1AQ9NR31 198 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL3Q9UH77 587 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PDE9AO76083 593 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TNFRSF8P28908 595 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PARP15Q460N3 678 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF470Q6ECI4 717 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DLG3Q92796 817 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PHF21BQ96EK2 531 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DUSP16Q9BY84 665 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 LHX5Q9H2C1 402 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 UNCXA6NJT0 531 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MEI4A8MW99 385 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 BTN3A1O00481 513 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 EOMESO95936 686 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GLUD1P00367 558 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CYP1A2P05177 515 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SRLQ86TD4 932 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 IRF6O14896 467 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 STX11O75558 287 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ITGA2P17301 1181 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ATP6V1B2P21281 511 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 S100A3P33764 101 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 HNMTP50135 292 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 AQP5P55064 265 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KCNMA1Q12791 1236 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TRAF2Q12933 501 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ANGPT1Q15389 498 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RBFAQ8N0V3 343 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TTPALQ9BTX7 342 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 HIPK3Q9H422 1215 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 UBP1Q9NZI7 540 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SYN3O14994 580 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 OR10H2O60403 315 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DNTTP04053 509 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FGF1P05230 155 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINB3P29508 390 aa6.47□□□□□ -1.37
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PDE4D-226ENST00000546160 ITGA7Q13683 1181 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DPYSL3Q14195 570 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CRY1Q16526 586 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 HYIQ5T013 277 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DENND1CQ8IV53 801 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MTERF3Q96E29 417 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 Q96MT0 163 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ASB8Q9H765 288 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 C8orf4Q9NR00 106 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 LAMB1P07942 1786 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 A0A096LPK6 155 aa6.47□□□□□ -1.37
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