RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 VAMP8Q9BV40 100 aa3.19□□□□□ -1.9
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JMJD1C-210ENST00000542921 TRABDQ9H4I3 376 aa3.19□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 CDH20Q9HBT6 801 aa3.19□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ZFP57Q9NU63 452 aa3.19□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
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JMJD1C-210ENST00000542921 CSTBP04080 98 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 GIMD1P0DJR0 217 aa3.19□□□□□ -1.9
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