RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 DMTF1Q9Y222 760 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 WASF2Q9Y6W5 498 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 GOLGA8CPA6NN73 597 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 APC2O95996 2303 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 CLCN6P51797 869 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 HDAC4P56524 1084 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 GSCP56915 257 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC20A2Q08357 652 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 SYCP1Q15431 976 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 C6orf118Q5T5N4 469 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 NEK5Q6P3R8 708 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ZYG11BQ9C0D3 744 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 PREBQ9HCU5 417 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 GDF3Q9NR23 364 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 OR12D3Q9UGF7 316 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM208BQ5VWN6 2430 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1W2PQU0 124 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 BNIP3LO60238 219 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 LEFTY1O75610 366 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 GIMD1P0DJR0 217 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 NUDT1P36639 197 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 STAT1P42224 750 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 PTPN9P43378 593 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 GNA12Q03113 381 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAJC3Q13217 504 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 FGL2Q14314 439 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM259Q4ZIN3 620 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 C22orf39Q6P5X5 142 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 WDR59Q6PJI9 974 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 DHRS13Q6UX07 377 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC25A45Q8N413 288 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 EID2Q8N6I1 236 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC185Q8N715 623 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 MDM1Q8TC05 714 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 KLK6Q92876 244 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 SKA1Q96BD8 255 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ERGIC2Q96RQ1 377 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 C11orf70Q9BRQ4 267 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 SYT11Q9BT88 431 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 SPON2Q9BUD6 331 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 HDAC8Q9BY41 377 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa12.06□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ACACAQ13085 2346 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM149AA5PLN7 773 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 TRABD2BA6NFA1 517 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 SIGLEC16A6NMB1 481 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 LGALS16A8MUM7 142 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ENC1O14682 589 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 LRIG2O94898 1065 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 PRNPP04156 253 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ITGAVP06756 1048 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 PRLRP16471 622 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 RHOQP17081 205 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 OVGP1Q12889 678 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 STAT4Q14765 748 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 CDO1Q16878 200 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 CARD16Q5EG05 197 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 LRSAM1Q6UWE0 723 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 TRIM72Q6ZMU5 477 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 STRADAQ7RTN6 431 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 HORMAD1Q86X24 394 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 PLPP6Q8IY26 295 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 DRC7Q8IY82 874 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 BAP1Q92560 729 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 BMFQ96LC9 184 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 CEP44Q9C0F1 390 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 RETREG1Q9H6L5 497 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 GPR27Q9NS67 375 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM248Q9NWD8 314 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 DKK4Q9UBT3 224 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 IL36AQ9UHA7 158 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 GPSM3Q9Y4H4 160 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 URB1O60287 2271 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 TRPM6Q9BX84 2022 aa12.04□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 TRIM38O00635 465 aa12.04□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 RAD51BO15315 384 aa12.04□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC31A1O15431 190 aa12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms