RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 FZD4Q9ULV1 537 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 MEI4A8MW99 385 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 SEMA4FO95754 770 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 CD160O95971 181 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 PRNPP04156 253 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 TGM1P22735 817 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 CHRNA3P32297 505 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 ACSL1P33121 698 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 TCEAL1Q15170 157 aa22.38■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 CARD16Q5EG05 197 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 SYT12Q8IV01 421 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 RGL4Q8IZJ4 473 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 ACTL7AQ9Y615 435 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.37■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 TMIEQ8NEW7 156 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 IL36AQ9UHA7 158 aa22.37■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 METTL12A8MUP2 240 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 ITPKAP23677 461 aa22.36■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 KLC2Q9H0B6 622 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 DYRK4Q9NR20 520 aa22.36■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 SUSD2Q9UGT4 822 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 PILRBQ9UKJ0 227 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 SARDHQ9UL12 918 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 TAS2R40P59535 323 aa22.35■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 CHST14Q8NCH0 376 aa22.35■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 CALN1Q9BXU9 219 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 TM6SF2Q9BZW4 377 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 SP110Q9HB58 689 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 SERGEFQ9UGK8 458 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 SLC7A4O43246 635 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 PRAMEF11O60813 436 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 TMCC1O94876 653 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 CTSLP07711 333 aa22.34■■□□□ 1.17
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