RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531959.5

PHF21A-215, Transcript of PHD finger protein 21A, human

TSL 5

Gene PHF21A, Length 507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF21A-215	ENST00000531959	CKAP5	Q14008	2032 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959		A0A1B0GVT2	93 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	CCDC189	A1A4V9	331 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	BTBD18	B2RXH4	712 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	FCGR1A	P12314	374 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	GNLY	P22749	145 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	CYP2J2	P51589	502 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	RCAN1	P53805	252 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	ABAT	P80404	500 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	DCTN1	Q14203	1278 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	C5orf22	Q49AR2	442 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	FSCB	Q5H9T9	825 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	RMI1	Q9H9A7	625 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	RASSF1	Q9NS23	344 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	DENND3	A2RUS2	1198 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	ASAP2	O43150	1006 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	IRAK2	O43187	625 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	TK1	P04183	234 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	CKMT1A	P12532	417 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	PRKCH	P24723	683 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	KLRC2	P26717	231 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	AVPR1A	P37288	418 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	ZBTB16	Q05516	673 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	TRAF1	Q13077	416 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	BIRC3	Q13489	604 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	CUL4B	Q13620	913 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	CUZD1	Q86UP6	607 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	HERVK_113	Q902F9	699 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	HIPK3	Q9H422	1215 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959		Q9N2J8	555 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PHF21A-215	ENST00000531959		A0A1B0GUV1	79 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	HMX3	A6NHT5	357 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	STMND1	H3BQB6	276 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959		I6L893	689 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	NCAM2	O15394	837 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	LIAS	O43766	372 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	TMCC1	O94876	653 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	SOX30	O94993	753 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	MMP3	P08254	477 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	PRPH2	P23942	346 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	SERPINA4	P29622	427 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	ACTR2	P61160	394 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	KIF5A	Q12840	1032 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	HLF	Q16534	295 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959		Q6ZSV7	163 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	RRAGA	Q7L523	313 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	CPO	Q8IVL8	374 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PHF21A-215	ENST00000531959	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		3.46	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms