RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
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PTPRU-210ENST00000527027 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
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PTPRU-210ENST00000527027 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRU-210ENST00000527027 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRU-210ENST00000527027 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRU-210ENST00000527027 POM121BA6NF01 834 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRU-210ENST00000527027 I6L893 689 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PTPRU-210ENST00000527027 J3QKU1 62 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRU-210ENST00000527027 BIN1O00499 593 aa16.44■□□□□ 0.22
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