RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516564.1

RNU6-358P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 358, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-358P, Length 75 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-358P-201ENST00000516564 CLCNKBP51801 687 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 TRIM60Q495X7 471 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZNF449Q6P9G9 518 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 SERPINA11Q86U17 422 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 TEX45Q8NA69 505 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR1N1Q8NGS0 311 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 TMEM163Q8TC26 289 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 HDAC7Q8WUI4 952 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 STYXQ8WUJ0 223 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 TXNDC15Q96J42 360 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 CCDC138Q96M89 665 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 FNIP2Q9P278 1114 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 RNMTO43148 476 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 LMX1BO60663 402 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 TNFRSF6BO95407 300 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 DDAH2O95865 285 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 LYL1P12980 280 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 ABCB4P21439 1286 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 MXI1P50539 228 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 KRTAP10-12P60413 245 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 MYBPHQ13203 477 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 EFHC1Q5JVL4 640 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 WDR5BQ86VZ2 330 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 POC1AQ8NBT0 407 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 TMEM18Q96B42 140 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 FRG2BQ96QU4 278 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 IFT27Q9BW83 186 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 ACAD9Q9H845 621 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 SLC22A11Q9NSA0 550 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 OSGIN2Q9Y236 505 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 RCE1Q9Y256 329 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 A0A1B0GVM2 712 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 TMEM247A6NEH6 219 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 AFPP02771 609 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 DDR1Q08345 913 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 ARL16Q0P5N6 197 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 SNTA1Q13424 505 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 TBRG1Q3YBR2 411 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 GXYLT1Q4G148 440 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 LCE1FQ5T754 118 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 SCN4BQ8IWT1 228 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 SYTL1Q8IYJ3 562 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 GPT2Q8TD30 523 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 RSC1A1Q92681 617 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 ARRDC3Q96B67 414 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 IL17FQ96PD4 163 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 EPYCQ99645 322 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 BRD8Q9H0E9 1235 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-358P-201ENST00000516564 DYTNA2CJ06 578 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 EFCAB8A8MWE9 144 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 PRAC2D3DTV9 90 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 SYN3O14994 580 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 MMP3P08254 477 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 CKMT1AP12532 417 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 DPP6P42658 865 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 STPG1Q5TH74 334 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 RHBDF2Q6PJF5 856 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 C11orf96Q7Z7L8 435 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 RBFAQ8N0V3 343 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 PGBD5Q8N414 524 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZNF114Q8NC26 417 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 NEK9Q8TD19 979 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 KLQ9UEF7 1012 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 DAPP1Q9UN19 280 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 ANO9A1A5B4 782 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 MAGEA13PA6NCF6 341 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 TULP2O00295 520 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 CLGNO14967 610 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 XPNPEP2O43895 674 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 CYP21A2P08686 494 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 AVPR2P30518 371 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 AK2P54819 239 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 CYP4A11Q02928 519 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 DLG1Q12959 904 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 SPARCL1Q14515 664 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 GALNTL6Q49A17 601 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 LRRC24Q50LG9 513 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 XKR9Q5GH70 373 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-358P-201ENST00000516564 CEP85LQ5SZL2 805 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms