RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 MT-CO1P00395 513 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 PCSK2P16519 638 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 GLDCP23378 1020 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 STARD6P59095 220 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 STK40Q8N2I9 435 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 RRN3Q9NYV6 651 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 H3BRJ5 948 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 GOT1P17174 413 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 ACVRL1P37023 503 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 JAM2P57087 298 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 AHI1Q8N157 1196 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 ATL2Q8NHH9 583 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 CHRDQ9H2X0 955 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 ACACBO00763 2458 aa6.69□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM72CH0Y354 149 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNK3O14649 394 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 AP5Z1O43299 807 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 TNFRSF21O75509 655 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 UGT2B4P06133 528 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 SP9P0CG40 484 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC8A1P32418 973 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM193AP78312 1265 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 AP1B1Q10567 949 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC18A3Q16572 532 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 FUT11Q495W5 492 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM72BQ86X60 149 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 BBS5Q8N3I7 341 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 CACNA1BQ00975 2339 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 H7C0C1 242 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 SIN3BO75182 1162 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 FTCDO95954 541 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP5OP48047 213 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 MMRN1Q13201 1228 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 LAYNQ6UX15 382 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 PEX26Q7Z412 305 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 RELL1Q8IUW5 271 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 NPY6RQ99463 290 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 SPSB2Q99619 263 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.68□□□□□ -1.34
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms