RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP4A11Q02928 519 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXE3Q13461 319 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CRYMQ14894 314 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP85Q6P2H3 762 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 KRT74Q7RTS7 529 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CMTM3Q96MX0 182 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 WDFY2Q96P53 400 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 YME1L1Q96TA2 773 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 KAT14Q9H8E8 782 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM247A6NEH6 219 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 SNAP23O00161 211 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 LIASO43766 372 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF202O95125 648 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 POU1F1P28069 291 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 MIIPQ5JXC2 388 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 ATG9BQ674R7 924 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 VRK3Q8IV63 474 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 REPS1Q96D71 796 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 STRA6Q9BX79 667 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 COL4A3Q01955 1670 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1W2PQ09 198 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1W2PQF6 199 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 IFNL4K9M1U5 179 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 PAGE4O60829 102 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 USP12O75317 370 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 NR2F1P10589 423 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 GCH1P30793 250 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 NNMTP40261 264 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 TAP1Q03518 808 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 EDRF1Q3B7T1 1238 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 C5orf22Q49AR2 442 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC184Q52MB2 194 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 NEK9Q8TD19 979 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 POMGNT1Q8WZA1 660 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP7D2Q96T17 732 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 OR2C1O95371 312 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 DDAH2O95865 285 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 UBA7P41226 1012 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 IRF3Q14653 427 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 TAF11Q15544 211 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 GPAT4Q86UL3 456 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 FRG2BQ96QU4 278 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 IFT27Q9BW83 186 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 SH2D4AQ9H788 454 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CXorf65A6NEN9 183 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC53A6NM62 1247 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 HEXAP06865 529 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CLTBP09497 229 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2G5P39877 138 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP2J2P51589 502 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-205ENST00000514178 PRAMEP78395 509 aa8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms