RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, human

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2B-208	ENST00000511807	PBK	Q96KB5	322 aa		11.63	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	PEBP4	Q96S96	227 aa		11.63	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	STIM2	Q9P246	746 aa		11.63	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		11.63	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		11.63	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	NUP205	Q92621	2012 aa		11.63	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	LRRD1	A4D1F6	860 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807		H0Y626	953 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	KCNK3	O14649	394 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	TIMM44	O43615	452 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	ACSL4	O60488	711 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	GJB3	O75712	270 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	TRIM16	O95361	564 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	KRT1	P04264	644 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	TCF4	P15884	667 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	KDELR1	P24390	212 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	L1CAM	P32004	1257 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	HTR7	P34969	479 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	ARL4A	P40617	200 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	DNA2	P51530	1060 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	COPA	P53621	1224 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	CDH6	P55285	790 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	ADGRF1	Q5T601	910 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	TMEM215	Q68D42	235 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	VSIG1	Q86XK7	387 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	NAXD	Q8IW45	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	ZNF366	Q8N895	744 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	SNX19	Q92543	992 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	ZNF592	Q92610	1267 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	KRT35	Q92764	455 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	EPAS1	Q99814	870 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	SIK2	Q9H0K1	926 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	CARD9	Q9H257	536 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	METTL12	A8MUP2	240 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807		H3BRJ5	948 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	CES2	O00748	559 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	DAPK3	O43293	454 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	HLA-F	P30511	346 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	HCAR3	P49019	387 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	TUBB2A	Q13885	445 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	CHST9	Q7L1S5	443 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	OR2T3	Q8NH03	318 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	ALG3	Q92685	438 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	CALN1	Q9BXU9	219 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	GAREM1	Q9H706	876 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	IL21R	Q9HBE5	538 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	SNX12	Q9UMY4	172 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		11.61	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	ZNF487	B1APH4	448 aa		11.6	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807		F5H5T6	163 aa		11.6	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	CREB3	O43889	395 aa		11.6	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	IGLV3-19	P01714	112 aa		11.6	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		11.6	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	TACR2	P21452	398 aa		11.6	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.6	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	SGSH	P51688	502 aa		11.6	□□□□□ -0.55
UBE2B-208	ENST00000511807	ARSE	P51690	589 aa		11.6	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.7 ms