RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 TWIST1Q15672 202 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 SLC18A3Q16572 532 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 FBXO43Q4G163 708 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 TBC1D9BQ66K14 1250 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 COLCA1Q6ZS62 124 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 TRIM74Q86UV6 250 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 TRIM73Q86UV7 250 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 PIM3Q86V86 326 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 FAM217AQ8IXS0 508 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 GHDCQ8N2G8 530 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 ESX1Q8N693 406 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 RFWD2Q8NHY2 731 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 HSPH1Q92598 858 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 SLC25A28Q96A46 364 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 HVCN1Q96D96 273 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 NLRP4Q96MN2 994 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 FCRL4Q96PJ5 515 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 CXorf56Q9H5V9 222 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 WASH6PQ9NQA3 447 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 TBC1D14Q9P2M4 693 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 SLC13A4Q9UKG4 626 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 CLDN16Q9Y5I7 305 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 C17orf102A2RUQ5 167 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 GAGE12JA6NER3 117 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 RNMTO43148 476 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 SERPINC1P01008 464 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 IL1AP01583 271 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 CHRM4P08173 479 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 PSG1P11464 419 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 XBP1P17861 261 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 CD53P19397 219 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 PTGR1Q14914 329 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 RPE65Q16518 533 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 NFIL3Q16649 462 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 CAMK1DQ8IU85 385 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM199Q8N511 208 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 KDM1BQ8NB78 822 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 RAB40AQ8WXH6 277 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 HTRA1Q92743 480 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 B3GNT4Q9C0J1 378 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 EYA2O00167 538 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 PER2O15055 1255 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 GUCY1B2O75343 617 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 ADAP00813 363 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRK-215ENST00000498284 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 YWHAQP27348 245 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 DPP6P42658 865 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 GPD2P43304 727 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 TMPRSS3P57727 454 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 TDGQ13569 410 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRK-215ENST00000498284 DNAAF1Q8NEP3 725 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 RUFY2Q8WXA3 655 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRK-215ENST00000498284 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF333Q96JL9 665 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 EYA3Q99504 573 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1B0GVC2 190 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 FAM157AC9JC47 383 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 HSPB6O14558 160 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 TUBP50607 506 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 ME3Q16798 604 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 LEXMQ3ZCV2 418 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 Q5PR19 223 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 WASHC2DQ5SRD0 308 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 NAA35Q5VZE5 725 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 PARM1Q6UWI2 310 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 SERPINA11Q86U17 422 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 MON1AQ86VX9 555 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa4.72□□□□□ -1.65
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