RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 APOEP02649 317 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PSMB4P28070 264 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CD52P31358 61 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NOS2P35228 1153 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 THPOP40225 353 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MTSS1LQ765P7 747 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZNF534Q76KX8 674 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 STRADAQ7RTN6 431 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PID1Q7Z2X4 250 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GJD3Q8N144 294 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PHC3Q8NDX5 983 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 C17orf50Q8WW18 174 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 RTP4Q96DX8 246 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 P2RY11Q96G91 374 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 LRRC37BQ96QE4 947 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ARL5CA6NH57 179 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 F8W810 466 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 I6L893 689 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GCATO75600 419 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DKK1O94907 266 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CBX6O95503 412 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FYNP06241 537 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GSTA1P08263 222 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 AOC1P19801 751 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 BNIP1Q12981 228 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FAM35AQ86V20 835 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GRAMD1AQ96CP6 724 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NPY6RQ99463 290 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 APOL2Q9BQE5 337 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 HAO1Q9UJM8 370 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CCDC78A2IDD5 438 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 H3BRJ5 948 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DAB1O75553 588 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 KRT37O76014 449 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ATP6V1G2O95670 118 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 KRT16P08779 473 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ERCC2P18074 760 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NAT1P18440 290 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 BDNFP23560 247 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MGAT1P26572 445 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GMPRP36959 345 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NR2C2P49116 596 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NHLH1Q02575 133 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 HTR4Q13639 388 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 RASA2Q15283 850 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GALNTL6Q49A17 601 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZMIZ2Q8NF64 920 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 RNF34Q969K3 372 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 APOPT1Q96IL0 206 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SPATA13Q96N96 652 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NELL2Q99435 816 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SIK2Q9H0K1 926 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 USP3Q9Y6I4 520 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 C1QAP02745 245 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ALDH3A1P30838 453 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ADRA1BP35368 520 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SERPINB4P48594 390 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FYB2Q5VWT5 728 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 RFX8Q6ZV50 586 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 STKLD1Q8NE28 680 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.16□□□□□ -1.26
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