RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 CXCR2P25025 360 aa17.27■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 RFX3P48380 749 aa17.27■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 CCT8P50990 548 aa17.27■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa17.27■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 DEPDC1Q5TB30 811 aa17.27■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 IRGQQ8WZA9 623 aa17.27■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 CAAP1Q9H8G2 361 aa17.27■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 CYLDQ9NQC7 956 aa17.27■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 KRT84Q9NSB2 600 aa17.27■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 TRPC4Q9UBN4 977 aa17.27■□□□□ 0.35
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NISCH-213ENST00000489895 DDR2Q16832 855 aa17.26■□□□□ 0.35
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NISCH-213ENST00000489895 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
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NISCH-213ENST00000489895 ZNF614Q8N883 585 aa17.26■□□□□ 0.35
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NISCH-213ENST00000489895 C10orf88Q9H8K7 445 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP17.26■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 UNCXA6NJT0 531 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 MAP2K7O14733 419 aa17.26■□□□□ 0.35
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NISCH-213ENST00000489895 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 FNIP1Q8TF40 1166 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 KREMEN1Q96MU8 473 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 TSPAN1O60635 241 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 MAGEC1O60732 1142 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 BTN2A3PQ96KV6 586 aa17.25■□□□□ 0.35
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NISCH-213ENST00000489895 NUP107P57740 925 aa17.25■□□□□ 0.35
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NISCH-213ENST00000489895 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa17.25■□□□□ 0.35
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NISCH-213ENST00000489895 FTH1P02794 183 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 ATP6V1B2P21281 511 aa17.25■□□□□ 0.35
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NISCH-213ENST00000489895 LRRN4CLQ8ND94 238 aa17.25■□□□□ 0.35
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NISCH-213ENST00000489895 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 FASP25445 335 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 CDK18Q07002 472 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 IYDQ6PHW0 289 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 TTC7BQ86TV6 843 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 CDK20Q8IZL9 346 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 ZNF786Q8N393 782 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 BSNDQ8WZ55 320 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 PCDH18Q9HCL0 1135 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 ZNF229Q9UJW7 825 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
NISCH-213ENST00000489895 PCDHGC3Q9UN70 934 aa17.25■□□□□ 0.35
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