RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF33AQ06730 810 aa16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 LINGO4Q6UY18 593 aa16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 Q6ZVU0 165 aa16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 C11orf74Q86VG3 221 aa16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 HMGB4Q8WW32 186 aa16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ALG3Q92685 438 aa16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 OLFM3Q96PB7 478 aa16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 TSGA13Q96PP4 275 aa16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 CEP192Q8TEP8 1941 aa16.88■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ABCA7Q8IZY2 2146 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 TMCC1O94876 653 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 GARSP41250 739 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 NHLH1Q02575 133 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 TFDP3Q5H9I0 405 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 USP30Q70CQ3 517 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 PEX26Q7Z412 305 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 HDAC11Q96DB2 347 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 SIPA1Q96FS4 1042 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC114Q96M63 670 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 MTG2Q9H4K7 406 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 DTLQ9NZJ0 730 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 AMFRQ9UKV5 643 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 PPM1HQ9ULR3 514 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 GUCA1BQ9UMX6 200 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 NUMA1Q14980 2115 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ANKRD36A6QL64 1941 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 J3KR12 359 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 HRO43593 1189 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ADH1BP00325 375 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 MX2P20592 715 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 PXNP49023 591 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 NUMBP49757 651 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 RWDD2BP57060 319 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 GBE1Q04446 702 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 TFDP2Q14188 446 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 SPDYCQ5MJ68 293 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 BBS12Q6ZW61 710 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 DSG4Q86SJ6 1040 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 STK40Q8N2I9 435 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 TEX26Q8N6G2 289 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 TMIEQ8NEW7 156 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 OR2AP1Q8NGE2 309 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 OR8D1Q8WZ84 308 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 MAML1Q92585 1016 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 LRIG1Q96JA1 1093 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 LHX3Q9UBR4 397 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 FAM186AA6NE01 2351 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 DFFAO00273 331 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 APOL1O14791 398 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 CTSLP07711 333 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 TGM2P21980 687 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 CSNK1DP48730 415 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 NR2C2P49116 596 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 CYTH1Q15438 398 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 CST6Q15828 149 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 CARD16Q5EG05 197 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ALG1LQ6GMV1 187 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 REXO1L1PQ8IX06 675 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 UBL4BQ8N7F7 174 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 TRIM58Q8NG06 486 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 PSKH2Q96QS6 385 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 TPSD1Q9BZJ3 242 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 BRD8Q9H0E9 1235 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 SLC6A17Q9H1V8 727 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 SP110Q9HB58 689 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-208ENST00000487290 AMACRQ9UHK6 382 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms