RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 ISM2Q6H9L7 571 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 GJB7Q6PEY0 223 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 KCNE4Q8WWG9 221 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 DEPDC7Q96QD5 511 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 CALN1Q9BXU9 219 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 HDAC8Q9BY41 377 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 DPH1Q9BZG8 443 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 COX16Q9P0S2 106 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF212Q9UDV6 495 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 LRRK2Q5S007 2527 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 NBASA2RRP1 2371 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 CAPN8A6NHC0 703 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZMPSTE24O75844 475 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 CSF2P04141 144 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC2A3P11169 496 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 KRT5P13647 590 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF18P17022 549 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 AKT2P31751 481 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 UCNP55089 124 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 CDH4P55283 916 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 APBA1Q02410 837 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 VAC14Q08AM6 782 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ARSIQ5FYB1 569 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 GUSBP11Q6P575 273 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 IFI44Q8TCB0 444 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 SATB2Q9UPW6 733 aa14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3-211ENST00000486441 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 CDRT15L2A8MXV6 281 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 K7ENP7 123 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 CD160O95971 181 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 C6P13671 934 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 PDX1P52945 283 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 PERM1Q5SV97 790 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 LINGO4Q6UY18 593 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 SMARCE1Q969G3 411 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 NT5C3BQ969T7 300 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 USP29Q9HBJ7 922 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 PIGVQ9NUD9 493 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 RELNP78509 3460 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 THAP12O43422 761 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 HSF2BPO75031 334 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 LEFTY1O75610 366 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 PCDH8O95206 1070 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 ERBB2P04626 1255 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 GNA15P30679 374 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 CXCR3P49682 368 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 NME3Q13232 169 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 CDKN3Q16667 212 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 MAPK15Q8TD08 544 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 RNF34Q969K3 372 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 NPY6RQ99463 290 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 SIK2Q9H0K1 926 aa14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms