RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PIF1	Q9H611	641 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	IKBKB	O14920	756 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TRIM24	O15164	1050 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CLIC2	O15247	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	YKT6	O15498	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	STC2	O76061	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FSBP	O95073	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SEMA4F	O95754	770 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ITGAV	P06756	1048 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	KRT13	P13646	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC130	P13994	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CD27	P26842	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ADORA2B	P29275	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	IL12RB1	P42701	662 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF165	P49910	485 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	NDST1	P52848	882 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MFAP3	P55082	362 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SEMG2	Q02383	582 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF234	Q14588	700 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	BROX	Q5VW32	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HDX	Q7Z353	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RNF139	Q8WU17	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DHX58	Q96C10	678 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SMO	Q99835	787 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RNF32	Q9H0A6	362 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SGK2	Q9HBY8	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SCML1	Q9UN30	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CACNA1E	Q15878	2313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PTPRB	P23467	1997 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388		A0A1W2PQH9	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FAM149A	A5PLN7	773 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ENC1	O14682	589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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