RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483728.5

SP140L-208, Transcript of SP140 nuclear body protein like, humanhuman

TSL 2

Gene SP140L, Length 3,070 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140L-208ENST00000483728 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 RPP38P78345 283 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 ACAP2Q15057 778 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 TAF12Q16514 161 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 TRIM16LQ309B1 348 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 NXPE1Q8N323 547 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 C17orf62Q9BQA9 187 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 AMNQ9BXJ7 453 aa8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 CHRDQ9H2X0 955 aa8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 TIGARQ9NQ88 270 aa8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 DNAJB5O75953 348 aa8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 RAC1P63000 192 aa8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 KRT17Q04695 432 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 MMEL1Q495T6 779 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 C5orf22Q49AR2 442 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 SFT2D3Q587I9 215 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 CCDC25Q86WR0 208 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 KRT12Q99456 494 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 TFR2Q9UP52 801 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 FAM221AA4D161 298 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 ATG13O75143 517 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 FKBP6O75344 327 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 APBB3O95704 486 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 PLCG1P19174 1290 aa8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 TFDP1Q14186 410 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 PPP1R35Q8TAP8 253 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 SPATA18Q8TC71 538 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 SLC5A5Q92911 643 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 FAM167AQ96KS9 214 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 PNMA5Q96PV4 448 aa8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.35□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 TMEM39BQ9GZU3 492 aa8.35□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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SP140L-208ENST00000483728 SOD2P04179 222 aa8.34□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 UGT1A6P19224 532 aa8.34□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 UGT1A1P22309 533 aa8.34□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 UGT1A4P22310 534 aa8.34□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 UGT1A3P35503 534 aa8.34□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 UGT1A5P35504 534 aa8.34□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 CACNB3P54284 484 aa8.34□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 PTPN5P54829 565 aa8.34□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 NAPAP54920 295 aa8.34□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 ACTR3P61158 418 aa8.34□□□□□ -1.07
SP140L-208ENST00000483728 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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