RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AP4S1Q9Y587 144 aa16.8■□□□□ 0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FFAR3O14843 346 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR42O15529 346 aa16.78■□□□□ 0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDH8O95206 1070 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLRC2P26717 231 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPK1P28482 360 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDKN2BP42772 138 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TUFMP49411 452 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCL23P55773 120 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP8P85298 464 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLD5Q8N7P1 536 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJB14Q8TBM8 379 aa16.78■□□□□ 0.28
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