RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 LRRC19Q9H756 370 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 FZD4Q9ULV1 537 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CEP192Q8TEP8 1941 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CFAP54Q96N23 3096 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 FRYLO94915 3013 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 DRD3P35462 400 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 IRX4P78413 519 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 DPYSQ14117 519 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 FAM46CQ5VWP2 391 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 AFMIDQ63HM1 303 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RGL4Q8IZJ4 473 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 TMIEQ8NEW7 156 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 FAM131CQ96AQ9 280 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 SLC39A8Q9C0K1 460 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 DONSONQ9NYP3 566 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 MEI4A8MW99 385 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 C10orf142B7Z368 130 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RNF103O00237 685 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 PLK4O00444 970 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 BUB1O43683 1085 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 NDST2P52849 883 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 TRIM61Q5EBN2 209 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CARD16Q5EG05 197 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 SLC23A3Q6PIS1 610 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RMDN1Q96DB5 314 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 PANX2Q96RD6 677 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 INTUQ9ULD6 942 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 WASF2Q9Y6W5 498 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 H3BRJ5 948 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 MTA2O94776 668 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 LCA5LO95447 670 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 DNA2P51530 1060 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 HADHQ16836 314 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 DUOXA1Q1HG43 343 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 POM121L1PQ3SYA9 428 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 PLPP6Q8IY26 295 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CEP76Q8TAP6 659 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 FAM71BQ8TC56 605 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 NETO1Q8TDF5 533 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 TSC1Q92574 1164 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 IL36AQ9UHA7 158 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 LNP1A1A4G5 178 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 PRNPP04156 253 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 FECHP22830 423 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 AMPD1P23109 780 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 MAN1A1P33908 653 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ARL4AP40617 200 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 SSR1P43307 286 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ARSEP51690 589 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R40P59535 323 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CNTN1Q12860 1018 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 TCEAL1Q15170 157 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ARSIQ5FYB1 569 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 NCEH1Q6PIU2 408 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CCDC170Q8IYT3 715 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 NPWQ8N729 165 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 NETO2Q8NC67 525 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 OR2T34Q8NGX1 318 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 C1orf216Q8TAB5 229 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RFFLQ8WZ73 363 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 VOPP1Q96AW1 172 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ARRDC3Q96B67 414 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 BIRC7Q96CA5 298 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 HEPHQ9BQS7 1158 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CAPN10Q9HC96 672 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 DLL3Q9NYJ7 618 aa21.33■■□□□ 1.01
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