RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 VAV1P15498 845 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 WASP42768 502 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 ST8SIA6P61647 398 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 MTAPQ13126 283 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 CYTH1Q15438 398 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 DLG2Q15700 870 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 CCDC181Q5TID7 509 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 SYT13Q7L8C5 426 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 TEX26Q8N6G2 289 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 ZNF366Q8N895 744 aa20.31■□□□□ 0.84
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ACTB-210ENST00000477812 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.31■□□□□ 0.84
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ACTB-210ENST00000477812 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.31■□□□□ 0.84
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ACTB-210ENST00000477812 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 MATN3O15232 486 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 C7P10643 843 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 COL9A1P20849 921 aa20.3■□□□□ 0.84
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ACTB-210ENST00000477812 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.3■□□□□ 0.84
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ACTB-210ENST00000477812 Q6ZVU0 165 aa20.3■□□□□ 0.84
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ACTB-210ENST00000477812 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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ACTB-210ENST00000477812 NNMTP40261 264 aa20.29■□□□□ 0.84
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ACTB-210ENST00000477812 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.29■□□□□ 0.84
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ACTB-210ENST00000477812 MCF2LO15068 1137 aa20.28■□□□□ 0.84
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ACTB-210ENST00000477812 GPR37L1O60883 481 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 SIN3BO75182 1162 aa20.28■□□□□ 0.84
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ACTB-210ENST00000477812 EPHX1P07099 455 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 RBP3P10745 1247 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 CCNB1P14635 433 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 RGRP47804 291 aa20.28■□□□□ 0.84
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ACTB-210ENST00000477812 PGBD5Q8N414 524 aa20.28■□□□□ 0.84
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ACTB-210ENST00000477812 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 IL12RB2Q99665 862 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 SEPT3Q9UH03 358 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 KMT2EQ8IZD2 1858 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 GSRP00390 522 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 SATB1Q01826 763 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 WASHC5Q12768 1159 aa20.27■□□□□ 0.84
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