RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 SNX18Q96RF0 628 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 DEF6Q9H4E7 631 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 HAO1Q9UJM8 370 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 AMFRQ9UKV5 643 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-209ENST00000473406 URADA6NGE7 173 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SCAMP1O15126 338 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP27B1O15528 508 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 NXPH3O95157 252 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 GOSR1O95249 250 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TYK2P29597 1187 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 STAT6P42226 847 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SCNN1GP51170 649 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 BLKP51451 505 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP4A11Q02928 519 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 WASHC5Q12768 1159 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 RESTQ13127 1097 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 AADACL2Q6P093 401 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PET117Q6UWS5 81 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 RTL10Q7L3V2 364 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 NEK8Q86SG6 692 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR78Q96P69 363 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PADI1Q9ULC6 663 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 GAGE12BA1L429 117 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 OR6C68A6NDL8 312 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TTC34A8MYJ7 566 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 MCIDASD6RGH6 385 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 NCR1O76036 304 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CDKL5O76039 1030 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PLATP00750 562 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAP00813 363 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT10P13645 584 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ITPKBP27987 946 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFS1P28331 727 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT2P35908 639 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 HNF4AP41235 474 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CAMPP49913 170 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 GNAQP50148 359 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 F2RL1P55085 397 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PSG6Q00889 435 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 UBXN1Q04323 297 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 LMAN2Q12907 356 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 GAB1Q13480 694 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 E2F5Q15329 346 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 CNGA3Q16281 694 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TXNDC8Q6A555 127 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6ZWC4 215 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 RAPH1Q70E73 1250 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 MOB3CQ70IA8 216 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SCAIQ8N9R8 606 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 DGAT2Q96PD7 388 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ALG8Q9BVK2 526 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL15Q9NXU5 204 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 EHD3Q9NZN3 535 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 OGFRQ9NZT2 677 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 DKK3Q9UBP4 350 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 XDHP47989 1333 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 IFNL4K9M1U5 179 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 HS6ST1O60243 411 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFS3O75489 264 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms