RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 NUP85Q9BW27 656 aa29.89■■■□□ 2.38
FBXO18-208ENST00000470089 HPCAL4Q9UM19 191 aa29.89■■■□□ 2.38
FBXO18-208ENST00000470089 CACNA1EQ15878 2313 aa29.89■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 LRRC72A6NJI9 287 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 RNF103O00237 685 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 ARHGAP33O14559 1287 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 CYP1A2P05177 515 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 IGHV4-34P06331 123 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TPM1P09493 284 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 ADKP55263 362 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 CNTN1Q12860 1018 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 OR2T34Q8NGX1 318 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 C1orf216Q8TAB5 229 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 ANAPC7Q9UJX3 599 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 NENFQ9UMX5 172 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 WASH4PA8MWX3 477 aa29.87■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 SYPP08247 313 aa29.87■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TCF4P15884 667 aa29.87■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 HMCESQ96FZ2 354 aa29.87■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TM6SF2Q9BZW4 377 aa29.87■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 CEP44Q9C0F1 390 aa29.87■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 KLC2Q9H0B6 622 aa29.87■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 ABHD10Q9NUJ1 306 aa29.87■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 RASA4BC9J798 803 aa29.86■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 RASA4O43374 803 aa29.86■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 KDELR3O43731 214 aa29.86■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 GRIK2Q13002 908 aa29.86■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 ARSIQ5FYB1 569 aa29.86■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 MINDY1Q8N5J2 469 aa29.86■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 DEF6Q9H4E7 631 aa29.86■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 IL36AQ9UHA7 158 aa29.86■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 CACNA1AO00555 2505 aa29.86■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 MFAP3LO75121 409 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 CD27P26842 260 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 IL1R2P27930 398 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 HTR7P34969 479 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 PCK1P35558 622 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 SMTNL2Q2TAL5 461 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 CARD16Q5EG05 197 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 PPM1JQ5JR12 505 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 KCNT1Q5JUK3 1230 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 AGBL4Q5VU57 503 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 ARRDC3Q96B67 414 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 NCAPGQ9BPX3 1015 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 ORAI3Q9BRQ5 295 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 PACSIN1Q9BY11 444 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TRIM5Q9C035 493 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TM9SF3Q9HD45 589 aa29.85■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TBC1D3EA0A087X179 549 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TBC1D3LB9A6J9 549 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 DAPK3O43293 454 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 BUB1O43683 1085 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 PRNPP04156 253 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TBC1D3HP0C7X1 549 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 ACAP1Q15027 740 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 SLC18A3Q16572 532 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 SARM1Q6SZW1 724 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 LAYNQ6UX15 382 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 NETO2Q8NC67 525 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 TMIEQ8NEW7 156 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 FAM131CQ96AQ9 280 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 CHP1Q99653 195 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 ZWILCHQ9H900 591 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 EBF2Q9HAK2 575 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 WASF2Q9Y6W5 498 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 DOCK9Q9BZ29 2069 aa29.84■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 SPTBN2O15020 2390 aa29.83■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 A0A1B0GVT2 93 aa29.83■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 LEFTY1O75610 366 aa29.83■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 PPP2CBP62714 309 aa29.83■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 PPP2CAP67775 309 aa29.83■■■□□ 2.37
FBXO18-208ENST00000470089 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms