RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469793.1

RAD18-208, Transcript of RAD18, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 2

Gene RAD18, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18-208ENST00000469793 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 ACTL9Q8TC94 416 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 MAML1Q92585 1016 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 FBRSQ9HAH7 460 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 CD248Q9HCU0 757 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 SUN2Q9UH99 717 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 A0A1W2PQF6 199 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 TTC34A8MYJ7 566 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 WASH3PC4AMC7 463 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 MCF2LO15068 1137 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 MATN3O15232 486 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 CEP104O60308 925 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 FGGP02679 453 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 TUBB4AP04350 444 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 EPHX1P07099 455 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 HLA-EP13747 358 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 CCR3P51677 355 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 DGKEP52429 567 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 CRY1Q16526 586 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 PLPP6Q8IY26 295 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 TEX26Q8N6G2 289 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 HAUS1Q96CS2 278 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 CCDC114Q96M63 670 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 LGMNQ99538 433 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD18-208ENST00000469793 K7ERQ8 282 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 MTSS1O43312 755 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 GSRP00390 522 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 WASP42768 502 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 CYTH1Q15438 398 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 Q6ZVU0 165 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 BBS5Q8N3I7 341 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 ZNF366Q8N895 744 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 CCNYQ8ND76 341 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 COG1Q8WTW3 980 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 PTPRN2Q92932 1015 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 PSKH2Q96QS6 385 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 LHX3Q9UBR4 397 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 SEPT3Q9UH03 358 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 AMACRQ9UHK6 382 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 ALOX15BO15296 676 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 SIN3BO75182 1162 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 VAV1P15498 845 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 COL9A1P20849 921 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 AVPR2P30518 371 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 CASQ1P31415 396 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 CXCL12P48061 93 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 RENBPP51606 427 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 NUBP1P53384 320 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 RHOAP61586 193 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 SLC10A7Q0GE19 358 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 AP1B1Q10567 949 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 ZNF235Q14590 738 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 ACCSLQ4AC99 568 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 MARC1Q5VT66 337 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.63□□□□□ -0.07
RAD18-208ENST00000469793 OR2T3Q8NH03 318 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms