RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 SGK2Q9HBY8 427 aa9.76□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 PCDH18Q9HCL0 1135 aa9.76□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.76□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 KLHL11Q9NVR0 708 aa9.76□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 IL36AQ9UHA7 158 aa9.76□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 NENFQ9UMX5 172 aa9.76□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 THADAQ6YHU6 1953 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 A0A1W2PP55 124 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 K7ERQ8 282 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 MCF2LO15068 1137 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 KRT86O43790 486 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 MTA2O94776 668 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 FSBPO95073 299 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 POP4O95707 220 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 SEMA4FO95754 770 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 CFIP05156 583 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 MX2P20592 715 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 COMTP21964 271 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 KDELR1P24390 212 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 RENBPP51606 427 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 VAV2P52735 878 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 COPAP53621 1224 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 ZNF33AQ06730 810 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 ITKQ08881 620 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 SPEM2Q0P670 501 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 SEMA3BQ13214 749 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 SERINC3Q13530 473 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TFDP2Q14188 446 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 ZNF235Q14590 738 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 POM121L1PQ3SYA9 428 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 ARSIQ5FYB1 569 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 USP30Q70CQ3 517 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 LRRC49Q8IUZ0 686 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 UBL4BQ8N7F7 174 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 CCNYQ8ND76 341 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 SKA1Q96BD8 255 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 PSMB7Q99436 277 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TM6SF2Q9BZW4 377 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 SLC39A8Q9C0K1 460 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 ALG6Q9Y672 507 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 CACNA1HO95180 2353 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 MACROD2A1Z1Q3 448 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 APOL1O14791 398 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 ARHGAP6O43182 974 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 LRP3O75074 770 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TMCC1O94876 653 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 PCDH8O95206 1070 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.853e-7■■■■□ 25.7
PKP4-208ENST00000462335 VAV1P15498 845 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TCF4P15884 667 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 BCKDHBP21953 392 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 NFKBIAP25963 317 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 CTNNA2P26232 953 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TAS2R40P59535 323 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 ARF5P84085 180 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 IL10RBQ08334 325 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 MMRN1Q13201 1228 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 DPYSQ14117 519 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 GRM3Q14832 879 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-208ENST00000462335 TCEAL1Q15170 157 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms