RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445180.2

LINC01648-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1648, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC01648, Length 1,519 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01648-201ENST00000445180 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 GPR158Q5T848 1215 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 PAFAH2Q99487 392 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 TBL1YQ9BQ87 522 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 VPS45Q9NRW7 570 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 SYBUQ9NX95 663 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 TBK1Q9UHD2 729 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 OBSL1O75147 1896 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 PER2O15055 1255 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 OXCT1P55809 520 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 CRADDP78560 199 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 IL31Q6EBC2 164 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 DENND5AQ6IQ26 1287 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 CASC4Q6P4E1 433 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 KDELC1Q6UW63 502 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 RANBP10Q6VN20 620 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 DCAKDQ8WVC6 231 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 TTC17Q96AE7 1141 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 TADA1Q96BN2 335 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ABHD8Q96I13 439 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 SPON2Q9BUD6 331 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 E2F8A0AVK6 867 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 FAM159BA6NKW6 160 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 PBX2P40425 430 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 MDH1P40925 334 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 WNT3AP56704 352 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ITKQ08881 620 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 TMED2Q15363 201 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 TEAD2Q15562 447 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 MPP7Q5T2T1 576 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 CERCAMQ5T4B2 595 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 TMEM135Q86UB9 458 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 TRABD2AQ86V40 505 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 LRRC6Q86X45 466 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 PGBD5Q8N414 524 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 APOL2Q9BQE5 337 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 FICDQ9BVA6 458 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 IL22Q9GZX6 179 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ARNT2Q9HBZ2 717 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 MYO7AQ13402 2215 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 H0Y626 953 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ZNF197O14709 1029 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 PMPCBO75439 489 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 PAPLNO95428 1278 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 POLBP06746 335 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 MMP2P08253 660 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 AVPR1AP37288 418 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 MPPE1Q53F39 396 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ARMC3Q5W041 872 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 RNF43Q68DV7 783 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 BBS5Q8N3I7 341 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC01648-201ENST00000445180 CARNMT1Q8N4J0 409 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms