RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442343.1

RPSAP40-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 40, humanhuman

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Gene RPSAP40, Length 891 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP40-201ENST00000442343 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 ANKRD7Q92527 254 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 RAD54LQ92698 747 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 ACCSQ96QU6 501 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 KCNK16Q96T55 309 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 MMS19Q96T76 1030 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 PLIN2Q99541 437 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 TRIM9Q9C026 710 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 DCLK3Q9C098 648 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 TMEM245Q9H330 911 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 CUEDC2Q9H467 287 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 GDF3Q9NR23 364 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 IFNKQ9P0W0 207 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 SCML2Q9UQR0 700 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 NME7Q9Y5B8 376 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.65□□□□□ -1.34
RPSAP40-201ENST00000442343 LRBAP50851 2863 aa6.65□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ZNF233A6NK53 670 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 A8MXQ7 604 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CLDN5O00501 218 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 STX10O60499 249 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 DNTTP04053 509 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 IGHV4-34P06331 123 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PRKCHP24723 683 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CD38P28907 300 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ATICP31939 592 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CLDN6P56747 220 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 NFKB2Q00653 900 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 IL9RQ01113 521 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CTBSQ01459 385 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PNOCQ13519 176 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TRIM14Q14142 442 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TMC6Q7Z403 805 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 FAM124AQ86V42 546 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 GPD1LQ8N335 351 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CPXM2Q8N436 756 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 EID2Q8N6I1 236 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SAAL1Q96ER3 474 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TNIP3Q96KP6 325 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CLIC6Q96NY7 704 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 THSD1Q9NS62 852 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CREBBPQ92793 2442 aa6.64□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 A0A1W2PR77 199 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 B2RBV5 119 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CBX4O00257 560 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 BIN1O00499 593 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 KLK10O43240 276 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 MAGEC1O60732 1142 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 STC2O76061 302 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 FSBPO95073 299 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TBX18O95935 607 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 MT-CO3P00414 261 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CYBBP04839 570 aa6.63□□□□□ -1.35
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