RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 VWA8A3KMH1 1905 aa28.08■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 TMEM114B3SHH9 223 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 UGP2Q16851 508 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 DNAL1Q4LDG9 190 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 CLLU1OSQ5K130 101 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 PNPOQ9NVS9 261 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ZNF195O14628 629 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 KIF3CO14782 793 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 KLHL2O95198 593 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 HLA-DQB2P05538 268 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 KDSRQ06136 332 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 GRM3Q14832 879 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 COLGALT2Q8IYK4 626 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 FICDQ9BVA6 458 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 FBXO44Q9H4M3 255 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 OSER1Q9NX31 292 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 NUDT5Q9UKK9 219 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 SLC39A10Q9ULF5 831 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 CDY1Q9Y6F8 540 aa28.07■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 TMEM88BA6NKF7 163 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA8TH3BQL2 631 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 RPSAP08865 295 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 SLC2A3P11169 496 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 CKBP12277 381 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 IDH3AP50213 366 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 NOMO2Q5JPE7 1267 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 NUP93Q8N1F7 819 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ACVR1CQ8NER5 493 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 RDH11Q8TC12 318 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 C8orf48Q96LL4 319 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 PLA2G4CQ9UP65 541 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 DNAJB1P25685 340 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 POU6F1Q14863 301 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 SLC39A13Q96H72 371 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 TLK1Q9UKI8 766 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 TCAF1Q9Y4C2 921 aa28.06■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 TRIM13O60858 407 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ELNP15502 786 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ELF1P32519 619 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 POLD2P49005 469 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ACSBG2Q5FVE4 666 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ARMC3Q5W041 872 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 C14orf80Q86SX3 495 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 RNF180Q86T96 592 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ARHGAP18Q8N392 663 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 FBXO27Q8NI29 283 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ZNF570Q96NI8 536 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 FSD1LQ9BXM9 530 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 MPP6Q9NZW5 540 aa28.05■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 H0Y3Z8 333 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ACLYP53396 1101 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 PIK3R6Q5UE93 754 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 TRAF7Q6Q0C0 670 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 CCDC78A2IDD5 438 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 SIN3BO75182 1162 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ALDH1A1P00352 501 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 FAM189BP81408 668 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 NAPRTQ6XQN6 538 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 RAPH1Q70E73 1250 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 KCNV2Q8TDN2 545 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 LINC01599Q8WXQ3 324 aa28.04■■■□□ 2.08
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CERS1-201ENST00000429504 TBC1D13Q9NVG8 400 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 OXSMQ9NWU1 459 aa28.04■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
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CERS1-201ENST00000429504 COL6A2P12110 1019 aa28.03■■■□□ 2.08
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CERS1-201ENST00000429504 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa28.03■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 WDR60Q8WVS4 1066 aa28.03■■■□□ 2.08
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CERS1-201ENST00000429504 TSNARE1Q96NA8 513 aa28.03■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 YY1AP1Q9H869 796 aa28.03■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 HTTP42858 3142 aa28.03■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 TM7SF2O76062 418 aa28.03■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 HSPA4LO95757 839 aa28.03■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ARNTP27540 789 aa28.03■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 MBTPS1Q14703 1052 aa28.03■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 CDH19Q9H159 772 aa28.03■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CERS1-201ENST00000429504 TREX1Q9NSU2 369 aa28.03■■■□□ 2.08
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