RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 C2CD2Q9Y426 696 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ACTL7BQ9Y614 415 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 F8VP50 259 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ACKR2O00590 384 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP2K7O14733 419 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 NFICP08651 508 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 GRIA3P42263 894 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPKAPK2P49137 400 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC6A3Q01959 620 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ITPK1Q13572 414 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS21Q2M5E4 152 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 DDI2Q5TDH0 399 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHH3Q7Z736 793 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 COMMD2Q86X83 199 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 STAG3L4Q8TBR4 150 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAM32Q8TC27 787 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 KIFC1Q9BW19 673 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CRYL1Q9Y2S2 319 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 DCDC2CA8MYV0 355 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 OR6B1O95007 311 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNA2P20248 432 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL5P46777 297 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 POLD2P49005 469 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CHN2P52757 468 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 NR1H2P55055 460 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PARP6Q2NL67 630 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ULK2Q8IYT8 1036 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPAN14Q8NG11 270 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2W1Q8TAV3 490 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC2A14Q8TDB8 520 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SELENOMQ8WWX9 145 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 IL22Q9GZX6 179 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 KLQ9UEF7 1012 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM50BQ9Y247 325 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SPEF2Q9C093 1822 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 UMPSP11172 480 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 GSTT1P30711 240 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM32Q13049 653 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 STK40Q8N2I9 435 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF398Q8TD17 642 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 LENG9Q96B70 501 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SMARCD1Q96GM5 515 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF1P21675 1872 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 GAKO14976 1311 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 AHCYL1O43865 530 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3BGRLO75368 114 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 MICAL2O94851 1124 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SLITRK3O94933 977 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PGM3O95394 542 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC24AO95486 1093 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 FGFR3P22607 806 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 HPCAL1P37235 193 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKCIP41743 596 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A3Q00325 362 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNIQ14094 377 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CRY1Q16526 586 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SPESP1Q6UW49 350 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA20Q8TB22 786 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CLIC5Q9NZA1 410 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCG1P45844 678 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 BST1Q10588 318 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 BIKQ13323 160 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PFKFB4Q16877 469 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC27A1Q6PCB7 646 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 BAP1Q92560 729 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PSME2Q9UL46 239 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TBKBP1A7MCY6 615 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 E5RJQ4 531 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDT14O95848 222 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 COX7A2P14406 83 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 KDELR1P24390 212 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ADSSP30520 456 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 FCGRTP55899 365 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2A13Q16696 494 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 BROXQ5VW32 411 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC30A10Q6XR72 485 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms