RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-202ENST00000423339 BTBD3Q9Y2F9 522 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-202ENST00000423339 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-202ENST00000423339 CECR2Q9BXF3 1484 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-202ENST00000423339 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PPH5 198 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 PER2O15055 1255 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 HBP1O60381 514 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 ST6GAL1P15907 406 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 BDNFP23560 247 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 GGT5P36269 586 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 DCAF7P61962 342 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF91Q05481 1191 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 MTA1Q13330 715 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 ETFDHQ16134 617 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 SLC18A3Q16572 532 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 MORN5Q5VZ52 161 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 SLC22A25Q6T423 547 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 UCMAQ8WVF2 138 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 PIGKQ92643 395 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 FRG2BQ96QU4 278 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 KCND2Q9NZV8 630 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 FBXO40Q9UH90 709 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 BICRAQ9NZM4 1560 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 SLC22A23A1A5C7 686 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 OR6C68A6NDL8 312 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 E5RJQ4 531 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 USO1O60763 962 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 URODP06132 367 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 LCKP06239 509 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 CHMP24386 653 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 MMP13P45452 471 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 CCR9P51686 369 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 CFHR1Q03591 330 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 FAM171A1Q5VUB5 890 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 C17orf99Q6UX52 265 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 TMTC3Q6ZXV5 915 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 IGFBPL1Q8WX77 278 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 SCNM1Q9BWG6 230 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 PDCL3Q9H2J4 239 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 EPHX3Q9H6B9 360 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 TAS2R10Q9NYW0 307 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D14Q9P2M4 693 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF112Q9UJU3 913 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 SCRIBQ14160 1630 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 PGPEP1LA6NFU8 196 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 TNFSF14O43557 240 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 STRNO43815 780 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 COX7A2P14406 83 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 SLC12A2P55011 1212 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 TDGQ13569 410 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 STIM1Q13586 685 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 ERV3-1Q14264 604 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 RPE65Q16518 533 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 C5orf22Q49AR2 442 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 CHD1LQ86WJ1 897 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 SCAIQ8N9R8 606 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 SMRP1Q8NCR6 262 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 ZMIZ2Q8NF64 920 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 IP6K1Q92551 441 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 USP44Q9H0E7 712 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 VEZTQ9HBM0 779 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 FBXO4Q9UKT5 387 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 SARDHQ9UL12 918 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-202ENST00000423339 SCINQ9Y6U3 715 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms