RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423113.5

ITGB1-205, Transcript of integrin subunit beta 1, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene ITGB1, Length 3,729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGB1-205	ENST00000423113	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	RAD51B	O15315	384 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	SPAG6	O75602	509 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	APOA1	P02647	267 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	INHBA	P08476	426 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	C7	P10643	843 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ITIH2	P19823	946 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ADSS	P30520	456 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	AQP5	P55064	265 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	MTM1	Q13496	603 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	TMC2	Q8TDI7	906 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CTRC	Q99895	268 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113		M0R3G1	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	COPE	O14579	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	TREH	O43280	583 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	CYP1A2	P05177	515 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	DLG4	P78352	724 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	STX3	Q13277	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	TTC13	Q8NBP0	860 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	CYGB	Q8WWM9	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	RUBCNL	Q9H714	662 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	IPP	Q9Y573	584 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	IFI30	P13284	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	CCNA2	P20248	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	FGFR3	P22607	806 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	ITGB8	P26012	769 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	HADHA	P40939	763 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	ART3	Q13508	389 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	KCNC3	Q14003	757 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	TFDP1	Q14186	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	POC5	Q8NA72	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62

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