RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 ARHGEF37A1IGU5 675 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 GPR182O15218 404 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 USP12O75317 370 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 CABYRO75952 493 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ANXA9O76027 345 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 AMHP03971 560 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 RAB27AP51159 221 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 PCID2Q5JVF3 399 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 LRRC49Q8IUZ0 686 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 MFSD3Q96ES6 412 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 VPS39Q96JC1 886 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 AGAP2Q99490 1192 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 MIOSQ9NXC5 875 aa24.18■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A2O15244 555 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 MAP3K7O43318 606 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ARRB2P32121 409 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 PGM2L1Q6PCE3 622 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 TAC4Q86UU9 113 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 PLCD3Q8N3E9 789 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 C3orf58Q8NDZ4 430 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ACTRT2Q8TDY3 377 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 MYLPFQ96A32 169 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 PKMYT1Q99640 499 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 OXSMQ9NWU1 459 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 FNIP2Q9P278 1114 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 HSPA4LO95757 839 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 JCHAINP01591 159 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 AGMOQ6ZNB7 445 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 JADE3Q92613 823 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 IL12RB2Q99665 862 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.17■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 SLCO1B7G3V0H7 640 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ATP9BO43861 1147 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ANPEPP15144 967 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 C1orf146Q5VVC0 180 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ZYG11AQ6WRX3 759 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ATG14Q6ZNE5 492 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 TSNARE1Q96NA8 513 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 CHRAC1Q9NRG0 131 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 TLK1Q9UKI8 766 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 M0QZQ0 153 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 OLIG2Q13516 323 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 GSTA3Q16772 222 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 TRIM68Q6AZZ1 485 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 PKN3Q6P5Z2 889 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 POTEHQ6S545 545 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 CNTD1Q8N815 330 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 UROC1Q96N76 676 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 DRC3Q9H069 523 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 NEU3Q9UQ49 428 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 SESN3P58005 492 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 MGAT3Q09327 533 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 EDEM1Q92611 657 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 COG4Q9H9E3 785 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ABCC13Q9NSE7 274 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ZNF358Q9NW07 568 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 RAP2CQ9Y3L5 183 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ARVCFO00192 962 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 MATN3O15232 486 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 IRAK2O43187 625 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 SCNN1GP51170 649 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 GEMP55040 296 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 ASPHQ12797 758 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 CFAP157Q5JU67 520 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 MANEALQ5VSG8 457 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 LIPMQ5VYY2 423 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 SERINC5Q86VE9 423 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 CNDP1Q96KN2 507 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 TBL1YQ9BQ87 522 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 VTI1BQ9UEU0 232 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-205ENST00000409985 PATJQ8NI35 1801 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms