RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 ARTNQ5T4W7 220 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CGB2Q6NT52 195 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CNKSR3Q6P9H4 555 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CYS1Q717R9 158 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RASSF3Q86WH2 238 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MICALL1Q8N3F8 863 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC63Q8NA47 563 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF511Q8NB15 262 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 HMCESQ96FZ2 354 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CERS2Q96G23 380 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM169Q96HH4 297 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TOX2Q96NM4 488 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 IL12RB2Q99665 862 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZYG11BQ9C0D3 744 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ATXN3LQ9H3M9 355 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP4F11Q9HBI6 524 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MTRRQ9UBK8 725 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPRDP23468 1912 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 J3KR12 359 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TLL1O43897 1013 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 GJB5O95377 273 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SEC24AO95486 1093 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 HLA-DQB2P05538 268 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RHOQP17081 205 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NPY2RP49146 381 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NEK3P51956 506 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MAXP61244 160 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 IRX4P78413 519 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB103AP81534 67 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ITIH4Q14624 930 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PCSK7Q16549 785 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SPANXN3Q5MJ09 141 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC8B1Q6J4K2 584 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PACS1Q6VY07 963 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 AUTS2Q8WXX7 1259 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MTBPQ96DY7 904 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF778Q96MU6 729 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 FCRL5Q96RD9 977 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 FICDQ9BVA6 458 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MANSC1Q9H8J5 431 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SP110Q9HB58 689 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NT5MQ9NPB1 228 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCF3Q9NUQ8 709 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TBX21Q9UL17 535 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SHROOM3Q8TF72 1996 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 E2F8A0AVK6 867 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 WASH4PA8MWX3 477 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 H0YHG0 523 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMD3O43242 534 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 EDF1O60869 148 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ANXA9O76027 345 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ACRP10323 421 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 BGNP21810 368 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NMBRP28336 390 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 OR1E1P30953 314 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CA8P35219 290 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ETFBP38117 255 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ETV4P43268 484 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCG1P45844 678 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SERPINB4P48594 390 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NIPAL4Q0D2K0 466 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 OVGP1Q12889 678 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 POU6F1Q14863 301 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SWI5Q1ZZU3 235 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ANO4Q32M45 955 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MARC1Q5VT66 337 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 OTOAQ7RTW8 1153 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00523Q86TU6 105 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM135Q86UB9 458 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms