RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391266.1

RNU6-1254P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1254, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1254P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CABLES2Q9BTV7 478 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C22orf23Q9BZE7 217 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HIPK3Q9H422 1215 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OGFRQ9NZT2 677 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CSAG2Q9Y5P2 127 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GXYLT2A0PJZ3 443 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CAPN9O14815 690 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KIF3BO15066 747 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PCDH7O60245 1069 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TCEA3O75764 348 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BRAFP15056 766 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PAX1P15863 534 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TSHRP16473 764 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MLLT10P55197 1068 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CYP4A11Q02928 519 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GPS1Q13098 491 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ENPP2Q13822 863 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM187Q14656 261 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CNGA2Q16280 664 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SNAI3Q3KNW1 292 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PLK5Q496M5 336 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC35E4Q6ICL7 350 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 WDR93Q6P2C0 686 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CEACAM20Q6UY09 585 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MAEAQ7L5Y9 396 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRIM74Q86UV6 250 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRIM73Q86UV7 250 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KLBQ86Z14 1044 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF584Q8IVC4 421 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM18Q96B42 140 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MTBPQ96DY7 904 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MOCOSQ96EN8 888 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CYYR1Q96J86 154 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR1F2PQ96R84 312 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MSTO1Q9BUK6 570 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZBTB26Q9HCK0 441 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KCNK9Q9NPC2 374 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KLHL1Q9NR64 748 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ABCB10Q9NRK6 738 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ABCF3Q9NUQ8 709 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM160Q9NX00 188 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF224Q9NZL3 707 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 USP35Q9P2H5 1018 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KCNS2Q9ULS6 477 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SMCHD1A6NHR9 2005 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A0A0MQY5 61 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM129A0AVI4 362 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CPED1A4D0V7 1026 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ASPDHA6ND91 283 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR2W5A6NFC9 320 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A6NNZ2 444 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ISM1B1AKI9 464 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HHLA1C9JL84 531 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NPC1O15118 1278 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DHHO43323 396 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OFD1O75665 1012 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GAGE7O76087 117 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMCC1O94876 653 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GAGE12FP0CL80 117 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GAGE12GP0CL81 117 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GAGE12IP0CL82 117 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PEPDP12955 493 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GNB3P16520 340 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HSD3B2P26439 372 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CHRNB4P30926 498 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RPL3P39023 403 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FMO5P49326 533 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FOXL2P58012 376 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC20A2Q08357 652 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GAGE1Q13065 139 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GAGE4Q13068 117 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PEX6Q13608 980 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CBFBQ13951 182 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms